Kapitel 4

Metodkarta

Denna figur visar ett antal vanligt använda analysmetoder inom molekylärpatologin. Figuren är uppdelad efter metoder som analyseras på DNA, RNA eller proteinnivå.

Analys av mindre mutationer genomförs i stort sett alltid på DNA-nivå och majoriteten av dessa analyser sker med NGS-baserade metoder. RNA används för att analysera genuttryck vilket till exempel används
i diagnostiken av viss bröstcancer. RNA-baserade analyser kan också användas för att hitta translokationer i till exempel lungcancer. Slutligen kan man genomföra analyser på proteinnivå vilket i det här sammanhanget framför allt rör immunhistokemiska analyser. Med dessa analyser kan man bedöma uttrycket av ett protein direkt i vävnaden.

En del analyser går att genomföra på olika nivåer. Till exempel mikrosatellitinstabilitet (MSI) som analyseras på DNA-nivå är en följd av bortfall av mismatch repair-proteiner (dMMR) vilket kan detekteras på proteinnivå.

Illustration som visar vanligt använda analysmetoder inom molekylärpatologin uppdelat på DNA, RNA eller proteinnivå.

Figur 4. Metodkartan

SWE-NP-0625-80005